RESUMO A detecção e identificação molecular de vírus são fundamentais para se definir estratégias de controle de viroses, tendo uma importancia crucial para vírus transmitidos por moscas-brancas. Plantas de algodoeiro (Gossypium) com sintomas de mosaico e redução de produtividade foram observadas em cultivares comerciais (G. hirsutum) e em acessos do banco de germoplasma de algodão da Embrapa mantidos em campo (G. hirsutum, G. barbadense, G. mustelinum). A extração de DNA a partir de plantas com sintomas de mosaico e clorose internerval e amplificação do genoma de begomovírus com primers degenerados e universais mostrou a associação com um begomovírus. Este vírus foi identificado como um isolado de sida micrantha mosaic virus (SiMMV) por sequenciamento do amplicon. O vírus não pode ser transmitido para algodão por mosca-branca (Bemisia tabaci MEAM1) quando plantas de algodão foram usadas como fonte de inóculo, em casa de cultivo protegido, sugerindo uma complexa interação entre vírus, plantas e vetores.

ABSTRACT Detection and molecular identification of viruses are fundamental to define control strategies against viral diseases, particularly for whitefly-transmitted viruses. Cotton (Gossypium) plants showing leaf mosaic symptoms and yield reduction were observed in commercial cultivars (G. hirsutum) and in plants of the cotton germplasm collection of Embrapa maintained in the field (G. hirsutum, G. barbadense, G. mustelinum). DNA was extracted from cotton plants with symptoms of mosaic and interveinal chlorosis, and a begomovirus-specific genome was amplified with degenerated universal primers, which indicated their association with a begomovirus. This virus was identified as an isolate of sida micrantha mosaic virus (SiMMV) after the amplicon sequencing. The virus could not be transmitted by whiteflies (Bemisia tabaci MEAM1) to cotton plants when the latter were used as inoculum source under protected cultivation house, suggesting a complex interaction among viruses, plants and vectors.

Abstract Cultivar BRS 433FL B2RF is a high-quality fiber upland cotton with high lint yield potential and resistance to several diseases. The introgressed transgenic events Bollgard II® and Roundup Ready Flex® confer enhanced resistance to lepidopteran pests and tolerance to the herbicide glyphosate, respectively. Fiber length exceeds 32.5 mm and fiber strength 33 gf tex-1.

Abstract Transgenic cotton cultivars BRS 430 B2RF and BRS 432 B2RF, medium and late season respectively, were developed by EMBRAPA in partnership with Bahia Foundation, aiming to create a high-yielding germplasm. The Bt toxins Cry1Ac and Cry2Ab target lepidopteran pests and the CP4-EPSPS gene confers tolerance to the herbicide glyphosate.

Abstract Cotton cultivar BRS 368RF was developed by EMBRAPA in a partnership with the Bahia Foundation, aiming to create high-yielding germplasm by adding transgenic traits addressed to Brazilian Savanna (cerrado) of the Northeast and North regions. BRS 368RF is a midseason cultivar and has yield stability and transgenic tolerance to glyphosate.

RESUMO. Os cotonicultores do mundo inteiro sofrem com as perdas causadas pela presença de fitonematoides nas lavouras. Assim o objetivo deste trabalho foi estudar a herança da resistência do acesso TX 25 de Gossypium hirsutum raça punctatum a Meloidogyne incognita raça 3. Foram utilizados acessos de Gossypium sp. pertencentes ao Banco de Germoplasma da Embrapa Algodão. Foram realizados dois experimentos em dois anos consecutivos. No primeiro ano foram testados FiberMax 966 e TX 25 como parentais suscetível e resistente, respectivamente, e as gerações F1, F2 e retrocruzamento. No segundo experimento foram testados os parentais FiberMax 966 e TX 25, a geração F2 além dos genótipos M315 (resistente) LA887 e DeltaOpal (moderadamente resistentes). Em ambos experimentos as plantas foram inoculadas com 2000 ovos e J2 de M. incognita raça 3. As avaliações ocorreram aos 120 dias após a inoculação, e avaliou-se índice de galhas, índice de massa de ovos e fator de reprodução. No primeiro experimento as plantas da geração F1 e do retrocruzamento se mostraram suscetíveis, As plantas da geração F2 nos dois experimentos apresentaram uma proporção de três plantas resistentes para uma suscetível indicando resistência de caráter oligogênico.

ABSTRACT. Cotton producers worldwide suffer with the losses caused by the presence of phytonematodes. The aim of the present study was to investigate the inheritance of resistance to Meloidogyne incognita race 3 in Gossypium hirsutum variety punctatum accession TX 25. Accessions of Gossypium sp. were obtained from the germplasm bank of Embrapa Cotton. Two experiments were performed in two consecutive years. In the first experiment, a susceptible parental line, FiberMax 966, a resistant parental line, TX 25, and their F1, F2 and backcross generations were tested. In the second experiment, parental lines FiberMax 966 and TX 25, their F2 generation, and genotypes M315 (resistant), LA887 and DeltaOpal (moderately resistant) were tested. In both experiments, plants were inoculated with 2000 eggs and J2 of M. incognita race 3. The gall index, egg mass index and reproduction factor were evaluated 120 days following inoculation. In the first experiment, plants from the F1 and backcross generations were susceptible. Plants from the F2 generation presented a 3:1 resistant-to-susceptible ratio in the two experiments, indicating oligogenic resistance.

Abstract BRS 369RF and BRS 370RF were developed by the EMBRAPA as a part of efforts to create high-yielding germplasm with combinations of transgenic traits. BRS 369RF and BRS 370RF are midseason cultivars and have yield stability, adaptation to the central Brazilian savanna, good fiber quality and tolerance to glyphosate herbicide.

Resumo: O objetivo deste trabalho foi identificar marcadores polimórficos de sequências simples repetidas (SSR) para identificação varietal de algodão e avaliação da distância genética entre as variedades. Inicialmente, 92 marcadores SSR foram genotipados em 20 cultivares de algodão do Brasil. Desse total, 38 locos foram polimórficos, dos quais dois deles foram amplificados por um único par de iniciadores; o número médio de alelos por loco foi 2,2. Os conteúdos de informação polimórfica (PIC) e de poder de discriminação (DP) foram, em média, 0,374 e 0,433, respectivamente. A distância genética média foi de 0,397 (mínima de 0,092 e máxima de 0,641). Um painel de 96 variedades originárias de diversas regiões do mundo foi avaliado por 21 locos polimórficos derivados a partir de 17 pares de iniciadores selecionados. Entre essas variedades, a distância genética média foi de 0,387 (mínima de 0 e máxima de 0,786). Os dendrogramas elaborados a partir de média aritmética não ponderada (UPGMA) não refletiram as regiões do Brasil (20 genótipos) ou do mundo (96 genótipos), onde as variedades ou linhagens foram selecionadas. O procedimento de reamostragem bootstrap mostra que a identificação dos genótipos é viável com 19 locos. Os marcadores polimórficos avaliados são úteis na identificação varietal de um painel amplo de variedades de algodão e podem ser aplicados em estudos de diversidade da espécie.

Abstract: The objective of this work was to identify polymorphic simple sequence repeat (SSR) markers for varietal identification of cotton and evaluation of the genetic distance among the varieties. Initially, 92 SSR markers were genotyped in 20 Brazilian cotton cultivars. Of this total, 38 loci were polymorphic, two of which were amplified by one primer pair; the mean number of alleles per locus was 2.2. The values of polymorphic information content (PIC) and discrimination power (DP) were, on average, 0.374 and 0.433, respectively. The mean genetic distance was 0.397 (minimum of 0.092 and maximum of 0.641). A panel of 96 varieties originating from different regions of the world was assessed by 21 polymorphic loci derived from 17 selected primer pairs. Among these varieties, the mean genetic distance was 0.387 (minimum of 0 and maximum of 0.786). The dendrograms generated by the unweighted pair group method with arithmetic average (UPGMA) did not reflect the regions of Brazil (20 genotypes) or around the world (96 genotypes), where the varieties or lines were selected. Bootstrap resampling shows that genotype identification is viable with 19 loci. The polymorphic markers evaluated are useful to perform varietal identification in a large panel of cotton varieties and may be applied in studies of the species diversity.

Variedades locais de algodão são fontes valiosas de diversidade genética. O objetivo deste estudo foi estimar a diversidade genética de algodoeiro mocó plantado na Paraíba e Rio Grande do Norte, utilizando marcadores de microssatélites. Um conjunto de 38 acessos - 21 plantas do Rio Grande do Norte e 17 da Paraíba - foi analisadas usando 24 pares de primers de microssatélites de algodão, que amplificaram 20 locos polimórficos. A média do índice de fixação foi de 0,432 e foi ligeiramente maior nos indivíduos da Paraíba do que do Rio Grande do Norte. A diversidade genética de Nei entre as amostras de cada estado apresentou valores similares (HT = 0,327 e 0,302 na Paraíba e Rio Grande do Norte, respectivamente), indicando que uma diversidade genética similar tem sido mantida. Logo, a proporção da diversidade genética entre as populações foi extremamente baixa (DST = 0,007), mas expressiva entre as mesorregiões (DST = 0,069). Conforme os dados, conclui-se que a similaridade genética entre as populações é alta.

The objective of this study was to estimate genetic diversity of cotton mocó planted in Paraíba and Rio Grande do Norte using microsatellite markers, since mocó landraces are a valuable source of genetic diversity. A set of 38 accessions - 21 plants from Rio Grande do Norte and 17 from Paraiba - was analyzed using 24 pairs of cotton microsatellite primers, which amplified 20 polymorphic loci. The average inbreeding was 0.432, and was slightly higher in individuals from Paraíba than from Rio Grande do Norte. Genetic diversity (Nei´s unbiased estimator) between individuals from each state's populations had similar values (HT = 0.327 and 0.302 in Paraíba and Rio Grande do Norte, respectively), indicating that comparable variability has been maintained. Moreover, the proportion of diversity between populations was extremely low (DST = 0.007), but expressive between mesoregions (DST = 0.069). These data led us to conclude that the genetic similarities between populations are high.

Cotton cultivar BRS 335 is a midseason high-yield cultivar and has adaptation to the Northeast Brazilian savanna, yield stability, desirable resistance to main cotton diseases and good fiber quality. The cultivar BRS 335 meets growers' demands for competitive lint yield as well as fulfilling industrial textile requirements.

O algodoeiro mocó foi a planta cultivada mais importante do Nordeste do Brasil. Variedades locais desenvolvidas anteriormente aos programas de melhoramento governamentais devem ser identificadas e preservadas como recurso genético. O objetivo deste trabalho foi selecionar marcadores SSR para monitorar o fluxo de genes do algodoeiro herbáceo para o mocó, usando plantas de algodoeiro herbáceo não transgênicas como fonte de pólen. Populações ferais de algodoeiro mocó raras foram identificadas no estado Rio Grande do Norte, e plantas mães e suas sementes foram coletadas. As freqüências alélicas foram estudadas nas plantas mãe utilizando 64 marcadores SSR. Dez marcadores SSR com alelos exclusivos dos algodoeiros mocós ou dos algodoeiros herbáceos foram usados para monitorar o fluxo gênico pela análise de paternidade (BNL3627; 2960; 2572; 3261; 3398; 3948; 3502; 3646 and CIR 094; 097). As sementes coletadas não possuíam nenhum alelo de algodoeiro herbáceo. A ausência de alelos exclusivos de algodoeiro herbáceo na progênie mostrou que o fluxo gênico para o algodoeiro mocó era ausente ou menor do que a análise pode detectar. Entre as plantas mãe, o número de indivíduos homozigotos em quatro locos polimórficos era maior que o esperado, mostrando que a reprodução ocorre preferencialmente por autofecundação ou cruzamento entre indivíduos aparentados. O teste de paternidade mede com acurácia o fluxo de genes, e pode ser utilizada para monitorar esta ou outras populações. A preservação das populações é ameaçada principalmente pela seca.

Mocó cotton was the most important crop in Northeastern Brazil. Local varieties had been developed before governmental breeding programs, which should be identified and preserved as a genetic resource. The aim of this work was to select SSR markers which can be used to monitor gene flow from herbaceous to mocó cotton plants, using non transgenic upland cotton as a pollen source. Unique mocó cotton feral populations were identified in the state of Rio Grande do Norte, and mother plants and their seeds were collected. Allele frequencies were studied among fifteen plants from these populations using 64 SSR primer pairs. Ten SSR markers, with alleles exclusive to mocó or upland genotypes, were selected to monitor gene flow by paternity analysis (BNL3627; 2960; 2572; 3261; 3398; 3948; 3502; 3646 and CIR 094; 097). The collected seeds had none of the upland cotton alleles. The absence of exclusive alleles from upland cotton in the offspring showed that gene flow to mocó cotton was absent or lower than the analysis could detect. Among the mother plants, the number of homozygous individuals at four polymorphic loci was greater than expected, showing that reproduction occurs preferentially by self-fertilization or crossing among related individuals. Paternity analysis is an accurate measure of gene flow, and the methodology can be used for monitor these populations or others. Preservation of the plants is spoiled mainly by drought.

A cultivar de algodoeiro BRS 336 possui alta qualidade de fibra, adaptação às principais regiões produtoras de algodoeiro no Brasil e resistência à mancha angular. BRS 336 possui comprimento de fibra acima de 32,0 mm e resistência da fibra superior às demais cultivares em uso no Brasil.

Cotton cultivar BRS 336 is a high-quality fiber upland cultivar and has wide adaptation to the Brazilian growing areas, with resistance to bacterial blight. BRS 336 exhibited fiber length higher than 32.0 mm in all field tests. Also, fiber strength exceeded all upland cotton currently grown in Brazil.

O objetivo deste trabalho foi caracterizar populações de Gossypium barbadense dos estados do Amapá e Pará. A caracterização in situ foi conduzida por meio de entrevistas com os proprietários das plantas e por observações sobre o ambiente. Tecidos de folhas ou de pétalas, além de sementes, foram coletados para a caracterização genética com marcadores SSR ("single sequence repeats") e para o armazenamento em bancos de germoplasma, respectivamente. As plantas eram mantidas em fundos de quintal e usadas, principalmente, para fins medicinais. As análises genéticas não mostraram plantas heterozigotas nos locos testados (f = 1), o que indica que a reprodução ocorre principalmente por meio de autofecundação. A diversidade genética total foi alta (He = 0,39), e um alto nível de diferenciação foi observado entre as plantas de algodoeiro dos dois estados (F ST = 0,36). Métodos convencionais para a manutenção in situ das populações de G. barbadense não são aplicáveis. A conservação da variabilidade genética das populações presentes nos dois estados deve ser realizada pela coleta de germoplasma e pela constituição de bancos de sementes ex situ.

The objective of this work was to characterize the populations of Gossypium barbadense in the states of Amapá and Pará, Brazil. In situ characterization was conducted through interviews with the owners of the plants and environmental observations. Leaf or petal tissue as well as seed samples were collected for genetic characterization by single sequence repeats markers and for storage in germplasm banks, respectively. The plants were maintained in dooryards and used mainly for medical purposes. The genetic analysis showed no heterozygous plants at the loci tested (f = 1), indicating that reproduction occurs mainly through selfing. The total genetic diversity was high (He = 0.39); and a high level of differentiation was observed between cotton plants from the two states (F ST = 0.36). Conventional methods of in situ maintenance of G. barbadense populations are not applicable. The conservation of the genetic variability of populations present in the two states could be achieved through germplasm collection and establishing of ex situ seed banks.

O objetivo deste trabalho foi selecionar coeficientes de similaridade para serem aplicados a conjuntos de genótipos de algodoeiro com baixa diversidade genética. Analisou-se um conjunto de 65 linhagens e 4 cultivares de algodão, com marcadores de RAPD e SSR, e estimou-se a similaridade genética de acordo com sete coeficientes de similaridade: Coincidência Simples, Rogers & Tanimoto, Ochiai, Hamman, Jaccard, Dice e Russel & Rao. A adequação dos coeficientes ao conjunto de genótipos foi verificada por correlação entre as matrizes de distância, índice de consenso entre os dendrogramas e otimização de Tocher. As análises mostraram que o coeficiente de Russel e Rao foi divergente em relação aos demais e seu uso não é recomendável. Entre os parâmetros usados para avaliar a qualidade de informação de cada coeficiente, apenas o índice de consenso estabeleceu diferenças e os classificou em dois grupos: aquele em que a ausência simultânea é considerada e aquele em que ela é desconsiderada. Considerando-se a presença de apenas dois alelos microssatélites por loco e os maiores índices de consenso, os coeficientes de Coincidência Simples, Hamman e Rogers & Tanimoto devem ser preferidos, quando em conjuntos de genótipos de algodoeiro melhorados e com baixa diversidade.

The objective of this work was to select similarity coefficients to be used among sets of cotton genotypes with low genetic diversity. Sixty-five lineages and four cotton cultivars were analyzed by RAPD and SSR markers; and the genetic similarity was estimated by seven similarity coefficients: Simple Matching, Rogers & Tanimoto, Ochiai, Hamman, Jaccard, Dice and Russel & Rao. The adequacy of the use of each coefficient to the collected data was verified by correlation between the distance matrices, the consensus index between the dendrograms and the Tocher's optimization method. The coefficient of Russel & Rao was the most divergent, and its use is not recommended. Among the parameters used to estimate the quality of information provided by each coefficient, differences were observed only by the consensus index, which established two groups: one in which simultaneous absence of bands are taken into account, and other in which it is excluded. Considering the presence of only two microsatellite alleles per polymorphic locus and the higher consensus index coefficients, the Simple Matching, Hamman and Rogers & Tanimoto coefficients should be preferred when analyzing cotton elite genotypes with low genetic similarity.

Algodoeiros de fibras coloridas apresentam qualidade inferior em relação aos de fibra branca, além de menor potencial de rendimento, porque, comparados aos brancos, os coloridos foram pouco explorados em termos de melhoramento genético. Este trabalho teve como objetivo avaliar o efeito da seleção massal para porcentagem de fibra alta, média e baixa, dentro de uma população da cultivar BRS Verde, lançada em 2003. Quinhentas plantas da cultivar BRS Verde foram colhidas ao acaso e estratificadas em quatro classes quanto à porcentagem de fibra. As sementes de cada classe foram misturadas e participaram de um ensaio em blocos ao acaso com quatro tratamentos, mais a população original e quatro repetições. Ficou evidenciada a eficiência da seleção massal em alterar a média das populações selecionadas e o ganho de seleção foi de 11% quanto à porcentagem de fibra.

The colored fiber cotton presents inferior quality in relation to the white one due to the fact that the colored was poorly studied as far as genetic breeding is concerned. The objective of this work was to verify the effect of mass selection for high, medium and low lint percentage in a population of the cotton cultivar BRS Verde. Five hundred plants were randomly harvested and after ginning, they were separated into four groups, based on lint percentage. Seeds within each class were mixed up to compose the treatments of a trial, ran as a complete randomized block design with four replicates. Treatments comprised four classes plus a sample of original population. Mass selection was efficient in changing the populations means and the overall genetic gain, concerning high lint percentage, was 11%.

A salinidade dos solos é um importante fator de estresse, ocorrendo em regiões semi-áridas e áridas do Nordeste brasileiro, onde a bananeira é cultivada. O efeito de diferentes concentrações de cloreto de sódio (NaCl) foi estudado sobre a multiplicação e o crescimento in vitro de brotos de bananeira da variedade "Grand Naine", visando a uma posterior seleção in vitro. Brotos de bananeira foram inoculados em meio de cultura MS (Murashige & SKoog) na ausência de T0=0 (controle) e na presença de três tratamentos contendo NaCl: T1= 50mM; T2=75mM e T3=100mM e subcultivados cinco vezes nos seus respectivos tratamentos. Os subcultivos foram realizados a cada 30 dias e observado o número de brotos multiplicados por broto inoculado em cada tratamento, a altura e o número de folhas dos brotos inoculados e a produção de matéria fresca aos 0; 30; 60; 90; 120 e 150 dias após a exposição ao sal. Os resultados mostraram que a adição de NaCl ao meio de cultura afetou a multiplicação in vitro, e que o aumento da concentração do sal é proporcional à diminuição do número de brotos produzidos. A multiplicação in vitro de brotos de bananeira foi reduzida em cerca de 80% na dose de 50mM e em cerca de 90% nas doses de 75 e 100mM. Nos tratamentos submetidos a 75 e 100 mM de NaCl, houve redução do número de folhas e também no crescimento dos brotos iniciais e na produção de matéria fresca. A melhor dose de NaCl entre as testadas e sob as condições experimentais utilizadas, para a realização de uma posterior seleção, foi 50mM por ter apresentado efeitos intermediários nos caracteres avaliados.

Soil salinity is an important factor of stress that occurs in many semi-arid and arid regions of Brazil where the bananeira is cultivated. The effect of different sodium chloride (NaCl) concentrations, in vitro, on the growth and shoot multiplication derived from explants of "Grand Naine" variety was studied. The shoot-tips of the bananeira were inoculated in MS media in the absence: T0=0 (control) and in the presence of three NaCl treatments: T1=50mM, T2=75mM e T3=100mM and sub cultured five times in the respective treatments. The subcultures were carried out every 30 days and the number of shoots multiplicated on each inoculated shoot, length and total number leaves of inoculated shoot and production of fresh weight were observed at 0; 30; 60; 90; 120 e 150 days after salt exposition. The results showed that the presence of NaCl in the media affects the shoot's production in vitro. The increase of NaCl concentration in the media is proportional to the decrease in the number of shoots produced. The multiplication of bananeira's shoot reduced about 80% in the treatment T1, while the treatments T2 and T3 achieved 90% of reduction. On the other hand the two saline treatments 75 and 100 mM interfered at the same form in the growth of shoots, production of fresh weight, length and total number of leaves. Under experimental conditions the best dose among the different sodium chloride was 50 mM because this dose showed intermediary effects on the characters evaluated.